Os dois novos Conselhos representam dois órgãos que consolidam a ação da Ordem dos Médicos. O Conselho de Supervisão é responsável por zelar pela legalidade da atividade dos órgãos da Ordem e exercer poderes de controle. O Conselho Nacional de Disciplina é responsável pela análise e decisão de processos disciplinares instaurados contra médicos. Ele garante a supervisão e disciplina dos médicos, atuando como um órgão independente dentro da Ordem. Ambos tiveram as suas Tomadas de Posse no auditório da Ordem dos Médicos, na sede de Lisboa.